学校肇始于1950年成立的长春市立中医进修学校，前身是1958年成立的长春中医学院，2006年更名为长春中医药大学。学校是吉林省省属重点大学、国家中西部高校基础能力建设工程高校、吉林省人民政府和国家中医药管理局共建高校、吉林省特色高水平大学建设高校。

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